本研究基于特异性位点扩增片段测序(SLAF-seq)技术,对河北昌黎、山东青岛和福建厦门三地文昌鱼群体开展全基因组SNP标记开发及群体遗传分析。COI序列比对分析发现,本次采集的3个群体与白氏文昌鱼Branchiostoma belcheri(AB478562.1)的同源性很高。基于SNP标记的遗传分析显示,厦门群体遗传多样性最高,青岛次之,昌黎最低。所有群体观测杂合度(Ho)均低于期望杂合度(He),表明群体可能受到选择、漂变、迁移等因素的影响。3个地区文昌鱼遗传多样性整体呈中度多态性(0.25PICFst)显示,厦门群体与昌黎和青岛群体之间存在中等程度的遗传分化,而昌黎与青岛群体之间遗传分化较为微弱。主成分分析和亲缘关系热图进一步表明昌黎与青岛群体遗传距离较近,厦门相对独立,可能受地理距离等因素影响。种群结构分析显示,当K=1时CV值最低,说明三地群体源于同一祖先。本研究有助于了解中国不同地区文昌鱼群体遗传现状,为制定差异化保护措施提供数据支持。
Ren et al. (Fri,) studied this question.
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