PUG-REST 업데이트: PubChem에 대한 프로그래밍적 접근을 위한 RESTful 인터페이스

PubChem (https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov)은 가장 큰 공개 화학 정보 자원 중 하나입니다. 현재 매달 평균 수백만 명의 고유 사용자를 확보하고 있으며, 화학 정보학, 화학 생물학, 약리 화학 및 약물 발견과 같은 여러 연구 분야에서 주요 자원으로 활용되고 있습니다. PubChem은 데이터 및 서비스에 대한 여러 프로그래밍적 접근 방법을 제공합니다. 그 중 하나가 PUG-REST로, PubChem에 대한 표현 상태 전이 (REST)와 유사한 웹 서비스 인터페이스입니다. 평균적으로 PUG-REST는 매일 수만 명의 고유 사용자로부터 백만 건 이상의 요청을 받습니다. 본 논문은 2015년에 발표된 이전 논문 이후의 PUG-REST에 대한 업데이트를 제공합니다. 여기에는 새로운 데이터 종류에 대한 접근(예: 간결한 생리활성 데이터, 목차 제목 등), 동기화된 빠른 구조 검색의 완전한 구현, NCBI의 GI 번호 사용 중단에 따른 접근 식별자를 사용하는 분석 데이터 검색 지원, List Gateway를 통한 PUG-REST와 NCBI의 E-Utilities 간 데이터 교환, 스로틀링을 통한 동적 트래픽 제어 구현, 그리고 향상된 사용 정책이 포함됩니다. 또한 사용자가 쉽게 수정, 실행 또는 다른 스크립팅 언어로 변환할 수 있는 예제 Perl 스크립트도 제공됩니다.