Uma análise pan-câncer multi-ômica dos genes de lactilação associados ao microambiente tumoral e ao desenvolvimento do câncer

ContextoA lactilação é uma importante modificação pós-traducional que conecta a epigenética do câncer ao reprogramação metabólica. No entanto, a associação entre lactilação e prognóstico, microambiente tumoral (TME) e resposta à terapia medicamentosa em vários tipos de câncer permanece pouco clara.MétodosPrimeiramente, foram explorados de forma sistemática a expressão, o valor prognóstico e as alterações genéticas e epigenéticas dos genes de lactilação em uma análise pan-câncer. Pontuações de lactilação foram derivadas para cada tumor usando o algoritmo de análise de enriquecimento de conjunto gênico por amostra única (ssGSEA). A correlação entre as pontuações de lactilação com características clínicas, prognóstico e TME foi avaliada pela integração de múltiplos métodos computacionais. Além disso, dados GSE135222 foram usados para avaliar a eficácia das pontuações de lactilação na predição dos resultados de imunoterapia. A expressão dos genes de lactilação em cânceres de mama e gliomas foi verificada por RNA-sequenciamento.ResultadosOs genes de lactilação foram significativamente regulados para cima na maioria dos tipos de câncer. CREBBP e EP300 exibiram altas taxas de mutação na análise pan-câncer. O impacto prognóstico da pontuação de lactilação variou conforme o tipo tumoral; a pontuação de lactilação foi um fator protetor para KIRC, ACC, READ, LGG e UVM, e um fator de risco para CHOL, DLBC, LAML e OV. Além disso, uma alta pontuação de lactilação associou-se a um TME “frio”. Os níveis de infiltração de células CD8+ T, γδT, células T natural killer (NKT) e células NK foram menores em tumores com pontuações de lactilação mais altas. Finalmente, a eficácia da imunoterapia foi pior em pacientes com pontuações altas de lactilação do que em outros grupos.ConclusãoOs genes de lactilação estão envolvidos na formação da malignidade. A pontuação de lactilação serve como um marcador promissor para predizer o prognóstico do paciente e a eficácia da imunoterapia.