Análise Baseada em Modelo de ChIP-Seq (MACS)

Resumo Apresentamos a Análise Baseada em Modelo de dados ChIP-Seq, MACS, que analisa dados gerados por sequenciadores de leitura curta como o Genome Analyzer da Solexa. O MACS modela empiricamente o tamanho do deslocamento das tags do ChIP-Seq e o utiliza para melhorar a resolução espacial dos sítios de ligação previstos. O MACS também usa uma distribuição de Poisson dinâmica para capturar efetivamente os vieses locais no genoma, permitindo previsões mais robustas. O MACS apresenta desempenho favorável em comparação com algoritmos existentes de identificação de picos em ChIP-Seq, e está disponível gratuitamente.