O Banco de Dados das Famílias de Proteínas Pfam

Pfam é uma grande coleção de alinhamentos múltiplos de sequências de proteínas e modelos ocultos de Markov perfilados. Pfam está disponível na WWW no Reino Unido em http://www.sanger.ac.uk/Software/Pfam/, na Suécia em http://www.cgr.ki.se/Pfam/ e nos EUA em http://pfam.wustl.edu/. A versão mais recente (4.3) do Pfam contém 1815 famílias. Estas famílias Pfam correspondem a 63% das proteínas no SWISS-PROT 37 e TrEMBL 9. Para genomas completos, o Pfam atualmente corresponde a até metade das proteínas. DNA genômico pode ser pesquisado diretamente contra a biblioteca Pfam utilizando o pacote Wise2.