O Classificador de qPCR CIN4 de Instabilidade Cromossômica Define Aneuploidia Tumoral e Estratifica o Resultado no Câncer de Mama Grau 2

OBJETIVO: Quantificar a instabilidade cromossômica (CIN) tem utilidade clínica prognóstica e preditiva no câncer de mama. Para estabelecer uma medida robusta e clinicamente aplicável da CIN baseada na expressão gênica, avaliamos a capacidade de quatro genes quantificados por qPCR, selecionados da assinatura de expressão de 70 genes de Instabilidade Cromossômica (CIN70), para estratificar o desfecho em pacientes com câncer de mama grau 2. MÉTODOS: AURKA, FOXM1, TOP2A e TPX2 (CIN4) foram selecionados da assinatura CIN70 devido ao seu alto nível de correlação com o grau histológico e a média da expressão da assinatura CIN70 in silico. Avaliamos a capacidade do CIN4 em estratificar o desfecho em uma coorte independente de pacientes diagnosticadas entre 1999 e 2002. 185 amostras fixadas em formalina e embebidas em parafina (FFPE) foram incluídas na medição qPCR da expressão de CIN4. Paralelamente, o status de ploidia dos tumores foi avaliado por citometria de fluxo. Investigamos se a pontuação categórica CIN4 derivada da assinatura CIN4 estava correlacionada com a sobrevida livre de recorrência (RFS) e o status de ploidia nesta coorte. RESULTADOS: Observamos associação significativa da proliferação tumoral, definida por Ki67 e índice mitótico (IM), com a expressão do CIN4 e aneuploidia. A pontuação CIN4 estratificou os carcinomas grau 2 em coortes prognósticas boas e ruins (RFS média: 83,8±4,9 e 69,4±8,2 meses, respectivamente, p = 0,016) e seu poder preditivo foi confirmado por análise multivariada, superando o IM e a expressão de Ki67. CONCLUSÕES: A primeira medida clinicamente aplicável derivada por qPCR da aneuploidia tumoral a partir de tecido FFPE, estratifica tumores grau 2 em grupos de prognóstico bom e ruim.