基底-上皮亚群是三阴性乳腺癌化疗耐药的基础并具有预测作用

三阴性乳腺癌（TNBC）是最具侵袭性的乳腺癌亚型，特征为肿瘤内高度异质性、高转移性和化疗耐药性，导致临床疗效差。尽管已有进展，但这些侵袭性行为的机制基础仍知之甚少。通过单细胞及空间转录组分析，我们发现位于间质中的基底上皮亚群表现出化疗耐药特征。该亚群由特异性标志基因定义，这些基因常见于拷贝数增加，并激活上皮-间质转化程序。其中一部分基因可准确预测化疗反应且与预后不良相关。有趣的是，这些基因中，升高的ITGB1参与增强细胞间信号传导，而ACTN1赋予细胞生存优势以促进化疗耐药。此外，通过将转录特征用于药物再利用分析，我们发现化疗耐药肿瘤在初治患者与新辅助化疗后患者中可能受益于不同的抑制剂。这些发现阐明了化疗耐药的机制基础，并提供了最佳的生物标志物以预测化疗反应及替代治疗途径，改善对化疗耐药TNBC患者的管理。