新辅助免疫检查点阻断治疗黑色素瘤中的空间分辨免疫标志物

摘要 背景：近期在黑色素瘤中的开创性新辅助免疫检查点阻断（NICB）临床试验明确表明，在有意治愈手术前使用ICB将成为转移性黑色素瘤及其他癌症的新标准治疗方案。由放射学反应评估向病理学反应评估的范式转变，也为获得丰富的“治疗中”组织样本以阐明反应机制和生物标志物、指导术后个性化治疗决策提供了无与伦比的“机会之窗”。迄今为止，单细胞/整体转录组研究已显示TCF7+类干细胞CD8+ T细胞及三级淋巴结构（TLS）是ICB反应的阳性预测因子。然而，这些免疫细胞如何在新辅助肿瘤微环境的空间背景中组织和交流，仍知之甚少。方法：我们研究了一组独特的91份来自87位III期转移性黑色素瘤患者的FFPE生物样本，其中60例接受NICB治疗（31例完全反应，7例部分反应，22例无反应），27例治疗前样本。我们采用最先进技术，包括多重误差稳健荧光原位杂交（MERFISH）、FFPE块的单细胞测序及多重免疫荧光，构建了这一丰富的数字资源。值得注意的是，为分析这些复杂的高维空间数据集，我们开发了三种新型计算算法，包括SCIRA，一种可扩展的空间受体-配体（R-L）相互作用定量方法；GC-SCAN，一种基于图的群集方法用于检测单细胞空间数据中的生发中心（GC）/TLS结构；以及PathNet，一种端到端的人工智能算法用于H&E染色的自动GC/TLS检测。 Part 1（常规摘要）；2026年4月17-22日；圣地亚哥，加利福尼亚。费城（宾夕法尼亚州）：AACR；Cancer Res 2026；86（7增刊）：摘要号6564。