PubTator：一个用于辅助生物信息整理的基于网络的文本挖掘工具

从生物医学文献中手工整理知识到结构化数据库的过程非常昂贵且耗时，使得难以跟上文献的快速增长。因此，迫切需要借助自动化文本挖掘工具来辅助生物信息整理。本文描述了PubTator，一个用于辅助生物信息整理的基于网络的系统。PubTator区别于少数现有工具之处在于其具备类似PubMed的界面，许多生物信息整理者对此界面感到熟悉，同时配备了多种挑战赛获奖文本挖掘算法，以确保其自动结果的质量。通过对两个外部用户群体的正式评估，PubTator被证明能够提高手工整理的效率和准确性。PubTator公开提供，网址为 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/CBBresearch/Lu/Demo/PubTator/。