一部分髓母细胞瘤中激活了干扰素反应基因表达特征

最新证据表明巨细胞病毒感染促进髓母细胞瘤的发展。髓母细胞瘤中抗病毒表达程序的差异性激活尚未被研究。 本研究中，我们评估了抗病毒转录反应在髓母细胞瘤中的相关性。我们分析了三组公开髓母细胞瘤基因表达数据集中Ⅰ型干扰素反应的基因表达特征。两项独立研究中发现干扰素反应基因显著协调调控。我们从两组数据中提炼出10个干扰素反应基因的特征。在第三个外部髓母细胞瘤数据集中，该特征展示了基因间表达水平的强显著相关性。我们的髓母细胞瘤IFN特征识别出一个先前未识别的患者亚群，部分与他人提出的WNT和SHH亚型重叠。我们得出结论：三组独立的髓母细胞瘤患者队列中均可发现抗病毒转录反应差异性激活的显著痕迹。这种IFN激活信号通常伴随增殖评分下降。我们提出的10基因Ⅰ型IFN反应基因特征，或可帮助评估其他髓母细胞瘤或癌症的基因表达数据集中的抗病毒状态。