El perfil genómico integrado identifica biomarcadores predictivos para la respuesta a la terapia neoadyuvante en cánceres de mama chinos

Resumen Antecedentes La terapia neoadyuvante (NAT) se ha convertido en una estrategia de tratamiento estándar para el cáncer de mama (CM) localmente avanzado, sin embargo, aún carece de marcadores predictivos efectivos. Métodos Construimos una cohorte a gran escala de NAT con 1,161 pacientes con CM primario, incluyendo 1,145 casos con datos clinicopatológicos pareados y secuenciación dirigida, para identificar biomarcadores de la eficacia de la NAT. Resultados El análisis sistemático identificó predictores pan-subtipo de la eficacia de NAT (por ejemplo, mutaciones en PIK3CA asociadas con resistencia en CM HR+/HER2− y triple negativo) y marcadores específicos de subtipo (por ejemplo, alteraciones en ERBB2 y GRIN2A que predicen resistencia en tumores enriquecidos en HER2). En pacientes sin respuesta patológica completa (no-pCR), múltiples alteraciones genómicas (por ejemplo, TP53 y TOP2A) fueron identificadas como predictores independientes de recurrencia metastásica. Además, un modelo de aprendizaje automático que integra mutaciones somáticas y características clínicas demostró una predicción consistente de la respuesta a NAT (AUC de entrenamiento = 0.82; AUC de validación = 0.81). Conclusiones En conjunto, nuestro estudio presenta un atlas genómico integral de la respuesta a NAT en poblaciones asiáticas, ofreciendo una guía molecular para regímenes de tratamiento personalizados que pueden mejorar los resultados clínicos.