Perfil transcripcional unicelular del carcinoma de células claras de riñón revela un fenotipo de célula punta endotelial asociada al tumor

El carcinoma de células claras de riñón (ccRCC) es la forma más prevalente de cáncer renal, representando más del 75 % de los casos. La naturaleza asintomática de la enfermedad contribuye a diagnósticos en etapas avanzadas y a una supervivencia pobre. El microambiente altamente vascularizado e infiltrado por células inmunitarias son características prominentes del ccRCC, sin embargo, la interacción entre la vasculatura y las células inmunitarias, la progresión de la enfermedad y la respuesta a la terapia sigue siendo poco comprendida. Utilizando secuenciación de ARN unicelular basada en gotas, perfilamos 50,236 transcriptomas de tejidos tumorales emparejados con tejidos renales sanos adyacentes. Nuestro análisis revela una heterogeneidad significativa y variabilidad entre pacientes en el microambiente tumoral. Notablemente, descubrimos una subpoblación de la vasculatura previamente no caracterizada asociada a la transición epitelio-mesenquimal. El análisis de comunicación célula-célula revela múltiples modos de interacciones inmunosupresoras dentro del microambiente tumoral, incluyendo interacciones clínicamente relevantes entre la vasculatura tumoral y células estromales con células inmunitarias. La sobreexpresión de los genes involucrados en estas interacciones se asocia con una supervivencia peor en la cohorte TCGA KIRC. Nuestros hallazgos demuestran el papel de la vasculatura tumoral y las poblaciones de células estromales en la configuración del microambiente del ccRCC y descubren una subpoblación de células dentro de la vasculatura tumoral que está asociada con un fenotipo angiogénico.