Perfilado espacial digital del microambiente del cáncer de vejiga musculoinvasivo

Resumen El cáncer de vejiga musculoinvasivo (MIBC) es una enfermedad molecularmente diversa con resultados clínicos variados. Los estudios moleculares suelen emplear análisis de secuenciación en conjunto, ofreciendo una instantánea transcriptómica de una sección del tumor. Sin embargo, los tejidos tumorales no son homogéneos, sino que están compuestos por compartimentos distintos como el tumor y el estroma. Para investigar los perfiles moleculares del cáncer de vejiga, manteniendo también la complejidad espacial de los tumores, utilizamos el Perfilado Espacial Digital (DSP) de transcriptoma completo. Con este método generamos un conjunto de datos de perfiles transcriptómicos del epitelio tumoral, estroma y infiltrado inmune. Con estos datos investigamos la relación espacial de firmas de subtipos moleculares y eventos de señalización por ligandos. Encontramos que los subtipos Basal/Escamoso y Clásico están mayormente restringidos a regiones tumorales, mientras que las firmas de subtipos ricos en estroma son abundantes dentro del propio estroma. Además, identificamos eventos de señalización por ligandos que ocurren entre regiones de tumor, estroma e infiltrado inmune, como GPNMB derivado del infiltrado inmune, que estuvo altamente correlacionado con la expresión de VEGFA dentro del tumor. Estos hallazgos nos brindan nuevas perspectivas sobre la diversidad del MIBC a nivel molecular y proporcionan un conjunto de datos con información espacial detallada que antes no estaba disponible en la investigación del cáncer de vejiga.