Resumen LB331: Integración de múltiples tecnologías transcriptómicas y proteómicas espaciales para generar un atlas del cáncer y comprender el microambiente tumoral

Resumen La genómica profunda de célula única ha proporcionado un avance monumental en nuestra comprensión y análisis categórico de las células cancerosas y sus propiedades moleculares únicas. Con plataformas espaciales que preservan la arquitectura tisular, una comprensión emergente de las interacciones celulares complejas y las influencias del ambiente local está brindando nuevas perspectivas para terapias dirigidas. Aquí describimos un enfoque integral para perfilar el microambiente inmune tumoral en múltiples malignidades sólidas para proporcionar un atlas de la biología tumoral. Para generar este atlas, creamos un panel MERFISH de 500 genes que representan más de 40 vías de fenotipificación celular y docenas de vías de señalización, incluyendo quimiocinas, citoquinas, interferón e interacciones ligando-receptor. Este panel se utilizó en 15 pacientes que representan múltiples malignidades sólidas. También utilizamos el panel Xenium enfocado en inmuno-oncología para perfilar 16 pacientes diferentes en las mismas indicaciones. Con los datos de Xenium evaluamos simultáneamente la expresión proteómica usando un panel de 16 plex enfocado en objetivos de inmuno-oncología y posteriormente realizamos H Parte 2 (Resumenes de Última Hora, Ensayos Clínicos y Resumenes Invitados); 5-10 de abril de 2024; San Diego, CA. Filadelfia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84 (7Suppl): Resumen nº LB331.