Resumen 1388: Análisis del transcriptoma espacial de la característica EMT y estudio de la composición inmune correspondiente en HNSCC

Resumen El carcinoma de células escamosas de cabeza y cuello (HNSCC) es un cáncer maligno prevalente a nivel mundial. Los tratamientos convencionales para este tipo de cáncer incluyen resección quirúrgica, radioterapia y quimioterapia. Sin embargo, en casos donde el tumor recurre o metastatiza a distancia, lo que hace impráctica la resección quirúrgica o la radioterapia, la única opción viable es la utilización de fármacos dirigidos junto con quimioterapia. A pesar de tales intervenciones, el pronóstico sigue siendo sombrío. Por lo tanto, la identificación de características genéticas o biomarcadores asociados con la metástasis o recurrencia fácil en las primeras etapas del tumor se ha vuelto imperativa para el tratamiento efectivo del cáncer de cabeza y cuello. El objetivo de este estudio es analizar muestras tumorales del sitio primario y la metástasis en ganglios linfáticos post resección quirúrgica en pacientes con HNSCC. Empleamos el GeoMx Digital Spatial Profiler (DSP) para el análisis digitizado de expresión génica basado en imágenes. El DSP proporciona información de expresión génica en ubicaciones específicas que seleccionamos, tales como el núcleo del tumor primario, los bordes de invasión del tumor primario y muestras de metástasis en ganglios linfáticos. La herramienta de análisis espacial GeoMx DSP ilustra el atlas del transcriptoma del cáncer (CTA), que abarca la expresión de 1825 genes relacionados con el cáncer y la inmunidad desde el sitio primario hasta el sitio metastásico. Identificamos patrones de expresión génica EMT específicos de tejido en regiones de interés emparejadas del tumor. ITGB1 surgió como el marcador de co-expresión más significativo en el tumor primario externo y el tumor metastásico. También se descubrieron genes con firmas EMT distintivas expresados en el sitio primario de HNSCC y el sitio metastásico en ganglios linfáticos. Además, realizamos perfiles CTA en ROIs de estroma correlacionados. A través del análisis de actividad mieloide en muestras emparejadas de HNSCC, identificamos firmas distintas de activación mieloide en las células del estroma en sitios primarios y metastásicos. Estos resultados proporcionarán perspectivas cruciales para las estrategias de tratamiento del cáncer de cabeza y cuello basadas en las características del sitio tumoral.