P02.06 Multi-ómicas integradas desvelaron una firma dependiente de células basales predictora del resultado y la respuesta a la inmunoterapia en LUSC

Antecedentes El carcinoma escamoso de pulmón (LUSC) es un gran causante de mortalidad por cáncer pulmonar sin biomarcadores y con opciones terapéuticas limitadas. Aunque aún no está claro, la transformación del epitelio seudoestratificado y basal está vinculada con su origen. Materiales y Métodos Con transcriptómica, proteómica, genómica, epigenética y secuenciación de ARN unicelular (scRNA-seq) integradas, exploramos firmas dependientes de células basales como predictores de respuesta terapéutica en LUSC. Resultados El agrupamiento no supervisado de la cohorte TCGA-LUSC clasificó a los pacientes en 'Basalimmune-alto' y 'Basalimmune-bajo' utilizando genes centrales asociados a células inmunes y basales. El grupo 'Basalimmune-alto' mostró mayores puntuaciones inmunes, infiltración de células inmunes (ICI) y mejor respuesta a inmunoterapia. El grupo 'Basalimmune-bajo' presentó una mayor puntuación de enriquecimiento proliferativo de células basales y mayor expresión de KRT5/6 y TP63. Ambos grupos mostraron un paisaje mutacional único y distintivo (mutaciones conductoras compartidas: TP53, KRTAP-5-5; Basalimmune-alto: NOTCH1, ZFR; Basalimmune-bajo: ARID1A, RECQL5). Los resultados de variantes en número de copias indicaron que ambos grupos tenían amplificaciones y deleciones compartidas, pero también individuales; amplificación - Basalimmune-alto: WHSC1L1, KAT6A; Basalimmune-bajo: EGFR, AKT1; deleción - Basalimmune-alto: ROBO1, FHIT; Basalimmune-bajo: STK11). Se identificaron 15 genes pronósticos clave y, por primera vez, CTTNBP2 y COL22A1 predijeron supervivencia en 4 cohortes diferentes de LUSC. El análisis de comunicación intercelular del scRNA-seq mostró una nueva dependencia comunicativa entre células basales e inmunes que podría influir en la respuesta a la inmunoterapia. Conclusiones Por primera vez, nuestro enfoque integrativo multi-ómico identificó grupos 'Basalimmune-alto' y 'Basalimmune-bajo' que difieren sustancialmente en su paisaje genético, una firma de 15 genes pronósticos clave que reflejan la supervivencia, y una comunicación dependiente de células basales que predice la respuesta a la inmunoterapia en LUSC. J. Jia: Ninguno. R. Liu: Ninguno. B. Deng: Ninguno. X. Guo: Ninguno. L. Trassl: Ninguno. G.A. Giotopoulou: Ninguno. S.J. Behrend: Ninguno. Y. Liu: Ninguno. A.Ö. Yildirim: Ninguno. G.T. Stathopoulos: Ninguno. A.C. Schamberger: Ninguno. I.E. Fernandez: Ninguno.