Determinantes de la calidad del ARN en muestras FFPE

Los grandes archivos de muestras de tejido fijadas en formol e incluidas en parafina (FFPE) existentes son una fuente muy valiosa de material de muestra para análisis biológicos moleculares, incluido el perfilado de expresión génica. Sin embargo, los datos actuales sobre los efectos adversos de la práctica patológica estándar en la utilidad de los analitos biomoleculares obtenidos de tales muestras archivadas son en gran parte anecdóticos. Aquí, presentamos un examen sistemático de los parámetros más relevantes para la integridad y la usabilidad del ARN obtenido de muestras FFPE, incluyendo el tiempo y condiciones de almacenamiento, tiempo de fijación y tamaño de la muestra. Los resultados son particularmente relevantes para cualquier aplicación que dependa de la síntesis de ADNc como paso inicial del procedimiento, como RT-PCR y análisis en microarrays.