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UCell es un paquete de R para evaluar firmas genéticas en conjuntos de datos de células individuales. Las puntuaciones de firmas UCell, basadas en la estadística U de Mann-Whitney, son robustas frente al tamaño y la heterogeneidad del conjunto de datos, y su cálculo requiere menos tiempo de computación y memoria que otros métodos disponibles, lo que permite procesar grandes conjuntos de datos en pocos minutos incluso en máquinas con capacidad computacional limitada. UCell se puede aplicar a cualquier matriz de datos de células individuales e incluye funciones para interactuar directamente con objetos Seurat. El paquete UCell y su documentación están disponibles en GitHub en https://github.com/carmonalab/UCell.
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Massimo Andreatta
Santiago J. Carmona
SHILAP Revista de lepidopterología
Computational and Structural Biotechnology Journal
University of Lausanne
SIB Swiss Institute of Bioinformatics
Ludwig Cancer Research
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Andreatta et al. (Vie,) estudiaron esta cuestión.
www.synapsesocial.com/papers/69d7ed8305ee2ba81dbee930 — DOI: https://doi.org/10.1016/j.csbj.2021.06.043
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