Evolución y ecología de los virus de la influenza A

En esta revisión examinamos la hipótesis de que las aves acuáticas son la fuente primordial de todos los virus de la influenza en otras especies y estudiamos las características ecológicas que permiten la perpetuación de los virus de la influenza en especies aviares acuáticas. El análisis filogenético de la secuencia nucleotídica de los segmentos de ARN del virus de la influenza A que codifican para las proteínas de espiga (HA, NA y M2) y las proteínas internas (PB2, PB1, PA, NP, M y NS) de una amplia gama de anfitriones, regiones geográficas y subtipos de virus de la influenza A respaldan las siguientes conclusiones. (i) Existen dos reservorios parcialmente superpuestos de virus de la influenza A en aves acuáticas migratorias y aves playeras en todo el mundo. Estas especies albergan virus de la influenza de todos los subtipos conocidos de HA y NA. (ii) Los virus de la influenza han evolucionado en una serie de linajes específicos de anfitriones que están ejemplificados por el gen NP e incluyen cepas de equino de Praga/56, cepas equinas recientes, cepas clásicas de cerdo y humanas, cepas de gaviota H13 y todas las demás cepas aviares. Otros genes muestran patrones similares, pero con extensa evidencia de reasortamiento genético. Se observan linajes geográficos así como específicos de anfitriones. (iii) Todos los virus de la influenza A de fuentes mamíferas se originaron del acervo genético aviar, y es posible que los virus de la influenza B también hayan surgido de la misma fuente. (iv) Los diferentes linajes virales son predominantemente específicos de los anfitriones, pero hay intercambios periódicos de genes de virus de la influenza o de virus completos entre especies, dando lugar a pandemias de enfermedad en humanos, animales inferiores y aves. (v) Los virus de la influenza que actualmente circulan en humanos y cerdos en América del Norte se originaron por la transmisión de todos los genes del reservorio aviar antes de la pandemia de influenza española de 1918; algunos de los genes han sido reemplazados posteriormente por otros del acervo genético de la influenza en aves. (vi) El acervo genético del virus de la influenza en aves acuáticas del mundo probablemente se perpetúa por la transmisión de bajo nivel dentro de esa especie durante todo el año. (vii) Hay evidencia de que la mayoría de las nuevas cepas y variantes pandémicas humanas han originado en el sur de China. (viii) Se especula que los cerdos pueden servir como el anfitrión intermedio en el intercambio genético entre los virus de la influenza en aves y humanos, pero falta evidencia experimental. (ix) Una vez que se comprenden las propiedades ecológicas de los virus de la influenza, puede ser posible interrumpir la introducción de nuevos virus de la influenza en humanos.