La carga mutacional y putativa de neoantígenos predicen el beneficio clínico de la terapia adoptiva con células T en melanoma

La terapia adoptiva con células T (ACT) es un régimen de inmunoterapia altamente intensivo que ha mostrado tasas de respuesta notables y muchas respuestas duraderas en ensayos clínicos en melanoma; sin embargo, el 50-60 % de los pacientes no obtiene beneficio clínico. Aquí, buscamos biomarcadores predictivos para ACT en melanoma. Se aplicaron secuenciación del exoma completo y transcriptoma, así como predicción de neoantígenos, en muestras pretratamiento de 27 pacientes reclutados en un ensayo clínico fase I/II de ACT en melanoma en estadio IV. Todos los pacientes habían progresado previamente con otras inmunoterapias. Reportamos que el beneficio clínico se asocia con una carga predicha de neoantígenos significativamente mayor. Una alta carga mutacional y de neoantígenos predichos se asocia de manera significativa con una mejor supervivencia libre de progresión y supervivencia global. Además, el beneficio clínico se asocia con la expresión de firmas de activación inmune incluyendo una alta puntuación en el procesamiento y presentación de antígenos MHC-I. Estos resultados mejoran nuestra comprensión de los mecanismos detrás del beneficio clínico de ACT en melanoma.