एकल-कोशिका स्थानिक ट्रांसक्रिप्टोमिक्स cutaneous squamous cell carcinoma में PD-1/PD-L1 ब्लॉकेड की प्रतिक्रिया नियंत्रित करने वाले निकेशों का पता लगाता है

पृष्ठभूमि नियोएजुवेंट PD-1/PD-L1 ब्लॉकेड उन्नत cutaneous squamous cell carcinoma (cSCC) में मजबूत प्रभावकारिता देता है, फिर भी कई रोगी पूर्ण या प्रमुख पैथोलॉजिक प्रतिक्रिया प्राप्त करने में विफल रहते हैं। कुछ रोगियों को प्रतिक्रिया क्यों मिलती है जबकि अन्य को नहीं, यह स्पष्ट नहीं है। विधियाँ हमनें PD-1/PD-L1 ब्लॉकेड की 1 खुराक से पहले, बाद में और 3–4 खुराकों के बाद cSCC नमूनों का प्रोफाइलिंग की ताकि प्रतिरोध तंत्रों का पता लगाया जा सके और उपचारात्मक प्रतिक्रिया की भविष्यवाणी हो सके। कुल मिलाकर, तीन समूहों में 27 रोगियों का अध्ययन किया गया, जिनमें दो चरण II के परीक्षण शामिल थे। हमने 1.7 मिमी टिशू-कोर माइक्रोऐरे बनाए और एकल-कोशिका स्थानिक ट्रांसक्रिप्टोमिक्स की, जिसमें स्थानिक क्लस्टरिंग, जीन-सेट प्रवर्धन, और स्थानिक सहसंबंध विश्लेषण शामिल थे। परिणाम सभी नमूनों के प्रोफाइलिंग के बाद छह विशिष्ट स्थानिक निकेश सामने आए, जो प्रतिक्रियादाताओं और गैर-प्रतिक्रियादाताओं में भिन्न रूप से समृद्ध थे। उच्च एंटीजन प्रस्तुति निकेश, B/प्लाज्मा सेल समृद्ध निकेश, और सूजनकारी केराटिनोसाइट निकेश प्रतिक्रियादाताओं में अधिक पाए गए, जबकि प्रोलिफेरेटिव केराटिनोसाइट, कम एंटीजन प्रस्तुति मायेलाइड, और फाइब्रोब्लास्ट-समृद्ध एपिथेलियल–मेसेंकाइमल संक्रमण निकेश गैर-प्रतिक्रियादाताओं में प्रमुख थे। ध्यान देने योग्य है कि प्रारंभिक उपचार नमूनों पर स्थानिक निकेश प्रोफाइलिंग पैथोलॉजिक प्रतिक्रिया की भविष्यवाणी में PD-L1 स्थिति से बेहतर थी। प्रत्येक निकेश ने विशिष्ट जीन सह-अभिव्यक्ति मॉड्यूल दिखाए, जो निकेश-विशिष्ट प्रतिरोध तंत्रों का सुझाव देते हैं। व्यक्तिगत ट्यूमर विश्लेषणों ने विभिन्न प्रतिरक्षा बचाव रणनीतियाँ प्रकट कीं, जिनमें दोषपूर्ण इंटरेफेरॉन-प्रेरित एंटीजन प्रस्तुति, प्रतिरक्षा दमनकारी मायेलाइड वातावरण, और एपिथेलियल–मेसेंकाइमल संक्रमण शामिल हैं। निष्कर्ष हमारा एकल-कोशिका स्थानिक ट्रांसक्रिप्टोमिक दृष्टिकोण छह स्थानिक निकेशों की पहचान करता है जो केवल 1.7 मिमी टिशू कोर का उपयोग करके PD-L1 स्थिति की तुलना में इम्यूनोथेरापी प्रतिक्रिया की बेहतर भविष्यवाणी करते हैं और बायोमार्कर विकास की जानकारी दे सकते हैं। हमारे परिणाम cSCC रोगियों में प्रतिरोध तंत्रों की विषमताओं को और भी उजागर करते हैं, जो अनुकूलित उपचारात्मक रणनीतियों की आवश्यकता को रेखांकित करते हैं।