走査型電子顕微鏡による細胞外染色体DNAの可視化のための標準化された試料調製プロトコル

細胞外染色体DNA（ecDNA）は、がんおよび薬剤耐性に関連する環状DNA構造です。特定のタイプであるダブルミニット（DM）染色体は、1960年代から細胞遺伝学や蛍光顕微鏡などのイメージング技術を用いて研究されています。原子間力顕微鏡（AFM）や走査型電子顕微鏡（SEM）などの特殊技術はマイクロからナノスケールでの可視化を可能にしますが、現在の試料調製法ではecDNA構造の最適な保持が難しい場合があります。本研究では、SEMを使用した高解像度のecDNA可視化のための体系的なプロトコルを紹介します。我々はエンドツーエンドの手順を最適化し、ecDNAの環状構造を探求するための標準化されたアプローチを提供し、がん研究における理解促進という緊急の課題に応えます。