P02.14 Hochplex-Ko-Erkennung von RNA und Protein zur Erforschung von Tumor-Immune-Interaktionen mittels RNAscope kombiniert mit Imaging Mass Cytometry

Hintergrund Die nächsten Durchbrüche in der Immunonkologie werden durch Hochplex-Werkzeuge vorangetrieben, die die räumliche Anordnung verschiedener Zelltypen im Tumormikromilieu (TME) entschlüsseln. Materialien und Methoden Imaging Mass Cytometry™ (IMC™) ist ein bewährtes Werkzeug zur Untersuchung komplexer zellulärer Interaktionen im TME. Es nutzt die CyTOF®-Technologie zur gleichzeitigen Bewertung von über 40 Proteinmarkern mit subzellulärer Auflösung ohne spektrale Überlappung oder Hintergrund-Autofluoreszenz und bietet somit bisher unerreichte Einblicke in die Organisation und Funktion des TME. Trotz dieser Vorteile sind einige Proteinziele in IMC schwer einzubeziehen, da nur wenige oder keine kommerziellen Antikörper verfügbar sind. Zudem kann die Zellidentität zwar leicht durch den Nachweis von Proteinmarkern entschlüsselt werden, doch verbessert das Wissen über das Zelltranskriptom das Verständnis von Zellfunktion und Aktivierungszustand. Ergebnisse Hier präsentieren wir einen robusten und zuverlässigen Workflow, der die hochsensitive und spezifische RNAscope™-Technologie für die RNA-Detektion mit der Multiplexfähigkeit von IMC kombiniert, um wichtige RNA- und Proteinmarker in denselben Tumorproben zu visualisieren. Schlussfolgerungen Der RNAscopeHiPlexv2-Assay wurde mit der Proteindetektion mittels IMC kombiniert, um die Expression von RNA- und Proteinmarkern in formalinfixiertem, paraffineingebettetem (FFPE) Tumorgewebemikroarray (TMA) zu evaluieren. J. Pemberton: A. Beschäftigung (voll- oder teilzeit); bedeutend; Standard BioTools. S. Kala: A. Beschäftigung (voll- oder teilzeit); bedeutend; Standard BioTools. A. Dikshit: A. Beschäftigung (voll- oder teilzeit); bedeutend; Standard BioTools. C. Hupple: A. Beschäftigung (voll- oder teilzeit); bedeutend; Standard BioTools.