Innovative Strategien zur DNA-Analyse mittels supramolekularer Assemblies und qPCR-Multiplexing

Diese Dissertation untersucht innovative DNA-basierte Nachweistechniken für die Diagnostik, mit Schwerpunkt auf dem Nachweis kurzer Zielsequenzen und einzelner Nukleotid-Polymorphismen (SNP), der Analyse von Schmelzkurven, hcPCR für Multiplexing, isothermer Photokontrolle mit DNA-Interkalatoren und einer integrierten Methode zur isothermen Amplifikation und Detektion unter Verwendung von Rolling Circle Amplification (RCA) und Lock-Sonden. Supramolekulare Assemblies molekularer Marker wurden für den Nachweis kurzer Zielsequenzen und SNPs untersucht, wobei der Assemblierungsprozess, Effizienzfaktoren und potenzielle Anwendungen aufgezeigt wurden. Ein neuer Informationsparameter aus der Schmelzkurvenanalyse wurde identifiziert, der die diagnostische Genauigkeit verbessert. Eine Proof-of-Concept hcPCR-Methode wurde entwickelt zur schnellen, multiplexen Analyse von PCR-Signalen, die Zeit, Kosten und Komplexität reduziert. Die isotherme Photokontrolle mit DNA-Interkalatoren wurde auf potenzielle diagnostische Anwendungen hin untersucht. Schließlich wurde ein integrierter Ansatz mit RCA und Lock-Sonden konzipiert, der effiziente Amplifikation mit spezifischer Zielerkennung kombiniert und neue Perspektiven für fortschrittliche molekulare Nachweisplattformen eröffnet.