تحليل تلوي لبيانات تسلسل الرنا يحدد الجينات المعبر عنها بشكل مختلف في العضلات الهيكلية بين الأفراد المصابين بالسمنة والأشخاص ذوي الوزن الطبيعي

تعيق السمنة أيض العضلات الهيكلية من خلال مقاومة الإنسولين، والإجهاد التأكسدي، وترسب الدهون الغريبة، ومع ذلك تظل النتائج الخاصة بالتعبير الجيني عبر الدراسات الفردية غير متسقة. أجرينا تحليلاً تلويًا لأربع دراسات مستقلة باستخدام تسلسل الرنا (RNA-seq) للعضلة الفاصلة الوحشية البشرية، مقارنًة بين 29 فردًا مصابًا بالسمنة (مؤشر كتلة الجسم (BMI) ≥ 30 كجم/م2) و23 فردًا ذو وزن طبيعي. تم تحليل التعبير التفريقي باستخدام DESeq2، مع تضمين العمر والجنس كعوامل مصاحبة في الدراسات التي كانت البيانات الفردية متاحة فيها. تم دمج نتائج الدراسات باستخدام طريقة الانعكاس الطبيعية ذات الاتجاه الواعي (Stouffer المرجح). تم تقييم التغايرية بين الدراسات بواسطة إحصائيات I2 على مستوى الجين المستمدة من تحليل تلوي عشوائي لتغيرات الطي اللوغاريتمي الثانية. أُجريت عمليات التوصيف الوظيفي باستخدام تحليلات جين أونتولوجي ومسارات موسوعة كيوتيو للجينات والجينومات (KEGG). حددت طريقة Stouffer المرجحة 2136 جينًا معبرًا عنها بشكل مختلف (p المعدلة < 0.05)، إذ تضمَّنت 1028 جينًا مرتفعة التعبير و1108 منخفضة التعبير، منها 674 (31.6%) تم اكتشافها فقط من خلال التحليل التلوي. ثلاثة جينات - PHLDA3 (منخفض)، CNKSR2 (منخفض)، وSFRP4 (مرتفع) - كانت مهمة في كل دراسة فردية وفي التحليل المشترك. كانت الجينات المنخفضة التعبير غنية في ترجمة السيتوبلازم، وتركيب الريبوسوم، والفوسفورية التأكسدية، بينما ارتبطت الجينات المرتفعة التعبير بتنظيم مصفوفة خارج الخلية ومسار التماسك البؤري. يكشف هذا التحليل التلوي لتسلسل الرنا في عضلات الهيكل العظمي في السمنة عن جينات معبر عنها بقوة ومسارات غير منتظمة، موفرًا أهدافًا مرشحة للأبحاث الميكانيكية والترجمية المستقبلية.