Pfam: 2021 में प्रोटीन परिवारों का डेटाबेस

Pfam डेटाबेस प्रोटीन अनुक्रमों को परिवारों और डोमेन में वर्गीकृत करने के लिए व्यापक रूप से उपयोग किया जाने वाला संसाधन है। इस जर्नल में Pfam के अंतिम विवरण के बाद, Pfam 33.1 में 350 से अधिक नए परिवार जोड़े गए हैं और मौजूदा प्रविष्टियों में अनेक सुधार किए गए हैं। COVID-19 पर शोध को सुविधाजनक बनाने के लिए, हमने SARS-CoV-2 प्रोटीओम को कवर करने वाली Pfam प्रविष्टियों की समीक्षा की है, और उन क्षेत्रों के लिए नई प्रविष्टियां बनाई हैं जिन्हें Pfam द्वारा कवर नहीं किया गया था। हमने Pfam-B को पुनः प्रस्तुत किया है, जो Pfam के लिए स्वचालित रूप से उत्पन्न पूरक प्रदान करता है और इसमें 136,730 नवीन अनुक्रम समूह शामिल हैं जो अभी तक Pfam परिवार द्वारा मेल नहीं खाते। नया Pfam-B MMseqs2 सॉफ़्टवेयर द्वारा क्लस्टरिंग पर आधारित है। हमने RepeatsDB में सभी क्षेत्रों की तुलना Pfam से की है और परिणामों का उपयोग Pfam रिपीट परिवारों के निर्माण और परिष्करण के लिए शुरू किया है। Pfam ब्राउज़िंग और डाउनलोड के लिए स्वतंत्र रूप से उपलब्ध है http://pfam.xfam.org/ पर।