Pan-Krebs-Immunogenomische Analysen enthüllen Beziehungen zwischen Genotyp und Immunphänotyp sowie Prädiktoren für das Ansprechen auf Checkpoint-Blockade

Das Cancer Genome Atlas hat die genomischen Landschaften menschlicher Krebserkrankungen aufgedeckt. Parallel dazu revolutioniert die Immuntherapie die Behandlung fortgeschrittener Krebsarten. Leider sprechen die meisten Patienten nicht auf die Immuntherapie an, weshalb die Identifikation prädiktiver Marker und Mechanismen der Resistenz ein intensiv erforschtes Gebiet ist. Um unser Verständnis der Wechselwirkungen zwischen Tumor und Immunzellen zu vertiefen, charakterisierten wir die intratumoralen Immunlandschaften und die Krebsantigenome von 20 soliden Tumoren und erstellten den Cancer Immunome Atlas (https://tcia.at/). Die zelluläre Charakterisierung der Immuninfiltrate zeigte, dass Tumorgenotypen Immunphänotypen und Tumorfluchtmechanismen bestimmen. Mithilfe von maschinellem Lernen identifizierten wir Determinanten der Tumorimmunogenität und entwickelten ein Bewertungssystem zur Quantifizierung, den sogenannten Immunphenoscore. Der Immunphenoscore stellte einen überlegenen Prädiktor für das Ansprechen auf Anti-cytotoxisches T-Lymphozyten-Antigen-4 (CTLA-4) und Anti-programmiertes-Zelltod-Protein 1 (Anti-PD-1)-Antikörper in zwei unabhängigen Validierungskohorten dar. Unsere Ergebnisse und diese Ressource könnten dazu beitragen, die Krebsimmuntherapie zu informieren und die Entwicklung der präzisionsbasierten Immunonkologie zu fördern.