COG 데이터베이스: 단백질 기능 및 진화의 게놈 규모 분석 도구

서열이 결정된 게놈에서 암호화된 단백질의 합리적인 분류는 기능적 및 진화적 연구를 위해 게놈 서열을 최대한 유용하게 만드는 데 필수적입니다. 단백질의 상동 그룹 클러스터(COGs) 데이터베이스는 박테리아, 고세균 및 진핵생물 21개의 완전한 게놈에서 암호화된 단백질의 계통발생학적 분류 시도입니다(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG). COG는 이들 게놈 단백질 서열을 모두 비교한 결과에 대해 게놈별 최고 적합(hit)의 일관성 기준을 적용하여 구축되었습니다. 데이터베이스에는 각 완전한 박테리아 및 고세균 게놈의 56-83%에 해당하는 유전자 산물과 효모 Saccharomyces cerevisiae 게놈의 약 35%에 해당하는 2091개의 COG가 포함되어 있습니다. COG 데이터베이스에는 새 단백질을 COG에 맞추기 위해 사용되는 COGNITOR 프로그램이 함께 제공되며, 이는 새로 시퀀싱된 게놈의 기능적 및 계통발생학적 주석에 적용될 수 있습니다.