PLIP 2025：タンパク質–リガンド相互作用プロファイラーへのタンパク質–タンパク質相互作用の導入

PLIP（タンパク質–リガンド相互作用プロファイラー）は、タンパク質構造における分子相互作用を解析します。PLIPは８種類の非共有結合相互作用を検出します。当初はタンパク質に対する低分子、DNA、RNAの相互作用に焦点を当てていましたが、現リリースではタンパク質–タンパク質相互作用を組み込んでいます。本機能の有用性を、がん治療薬ベネトクラクスのPLIP相互作用とBcl-2とBAXのネイティブなタンパク質–タンパク質相互作用と比較することにより示します。PLIPは、薬剤がネイティブな相互作用を模倣する様子を明らかにし、相互作用プロファイルに重要な重なりがあることを示しています。PLIPはウェブサーバー、コンテナ付きソースコード、Jupyterノートブックとして利用可能です。PLIPウェブサーバーは https://plip-tool.biotec.tu-dresden.de にてオンラインで利用できます。