Verwendung der ChEMBL-Webservices zum Erstellen von Anwendungen und Datenverarbeitungs-Workflows im Bereich der Wirkstoffforschung.

ChEMBL ist eine manuell kuratierte Datenbank mit Bioaktivitätsdaten zu kleinen, wirkstoffähnlichen Molekülen, die von Wissenschaftlern in der Wirkstoffforschung genutzt wird. Unter vielen Zugriffsmöglichkeiten bietet eine REST-API programmgesteuerten Zugriff, der die entfernte Abfrage von ChEMBL-Daten und deren Integration in andere Anwendungen erlaubt. Dieser Ansatz ermöglicht es Wissenschaftlern, von einer Welt, in der sie die ChEMBL-Webseite aufrufen, um relevante Daten zu suchen, hin zu einer Welt zu gelangen, in der ChEMBL-Daten einfach in ihre alltäglichen Werkzeuge und Arbeitsumgebungen integriert werden können. Abgedeckte Bereiche: Diese Übersicht hebt einige Zielgruppen hervor, die von der Nutzung der ChEMBL-API profitieren können, und die Ziele, die sie durch die Beschreibung mehrerer Anwendungsfälle adressieren können. Die Beispiele umfassen ein Teamkommunikationstool (Slack), eine Datenanalyseplattform (KNIME), Batch-Job-Management-Software (Luigi) und Rich-Internet-Anwendungen. Expertenmeinung: Das Aufkommen von Webtechnologien, Cloud-Computing und microservice-orientierten Architekturen hat REST-APIs zu einem wesentlichen Bestandteil moderner Softwareentwicklungsmodelle gemacht. Die weitverbreitete Verfügbarkeit von Tools, die RESTful-Ressourcen nutzen, hat sie für viele Nutzergruppen nützlich gemacht. Die ChEMBL-API ist eine wertvolle Ressource mit Bioaktivitätsdaten für die Wirkstoffforschung für professionelle Chemiker, Chemie-Studierende, Datenwissenschaftler sowie wissenschaftliche und Web-Entwickler.