जीन्स के समूहों के लिए एक वैश्विक परीक्षण: एक नैदानिक परिणाम के साथ संबद्धता का परीक्षण

प्रेरणा: यह पेपर माइक्रोएरे डेटा के विश्लेषण के लिए एक वैश्विक परीक्षण प्रस्तुत करता है। इस परीक्षण का उपयोग करके यह निर्धारित किया जा सकता है कि किसी जीन समूह के वैश्विक अभिव्यक्ति पैटर्न का कोई महत्वपूर्ण संबंध किसी नैदानिक परिणाम से है या नहीं। जीनों के समूह का आकार किसी एक जीन से लेकर चिप पर मौजूद सभी जीनों तक हो सकता है (जैसे ज्ञात मार्ग, जीनोम के विशिष्ट क्षेत्र या क्लस्टर विश्लेषण से प्राप्त क्लस्टर)। परिणाम: यह परीक्षण विभिन्न आकार के जीन समूहों की तुलना करने की अनुमति देता है क्योंकि परीक्षण समूह के लिए एक p-मूल्य देता है, न कि प्रत्येक जीन के लिए। शोधकर्ता इस परीक्षण का उपयोग सिद्धांत या पिछले शोध पर आधारित परिकल्पनाओं की जांच के लिए या रुचिकर पाथवे के लिए जीन ओन्टोलॉजी डेटाबेस को खोदने के लिए कर सकते हैं। बहु-परीक्षण समस्याएं केवल तब उत्पन्न होती हैं जब कई समूहों का परीक्षण किया जाता है। परीक्षण परिणाम के दृश्यावलोकन पर विशेष ध्यान दिया गया है, जिसमें नमूनों के बीच संबद्धताओं पर ध्यान केंद्रित किया गया है और परीक्षण परिणाम पर व्यक्तिगत जीनों के प्रभाव को दिखाया गया है। उपलब्धता: R-पैकेज globaltest http://www.bioconductor.org से उपलब्ध है।