FlyPredictome: Ein struktureller Atlas der vorhergesagten Protein-Protein-Wechselwirkungen bei Drosophila

Zusammenfassung Protein-Protein-Wechselwirkungen (PPIs) sind grundlegend für die zelluläre Funktion. Dennoch bleiben die meisten Drosophila-PPIs strukturell uncharakterisiert, trotz der Fülle genetischer und biochemischer Daten, die für diesen Organismus vorliegen. Hier präsentieren wir FlyPredictome, ein strukturelles Interakteom basierend auf 1,5 Millionen paarweisen AlphaFold-Multimer-Vorhersagen. Mithilfe einer lokalen Vertrauensmetrik, die bei Wechselwirkungen flexibler und ungeordneter Proteine robust funktioniert, bewerten wir systematisch experimentell berichtete Drosophila-PPIs und sagen direkte Bindungsschnittstellen auf Rest-Ebene vorher. Zur Prüfung ihrer funktionellen Relevanz stellen wir fest, dass phänotypassoziierte Missense-Mutationen an den vorhergesagten Interaktionsschnittstellen angereichert sind. Aufbauend auf diesen validierten Vorhersagen konstruieren wir ein durch Evidenz unterstütztes PPI-Netzwerk, das eine modulare Organisation von Signalwegen bis hin zu einzelnen Proteinkomplexen offenbart. FlyPredictome ist als offene Datenbank verfügbar und bietet eine strukturelle Grundlage zur Entdeckung von Interaktionen in Drosophila.